В составе государственного университета морского и речного транспорта (ГУМРФ) им. адмирала С. О. Макарова по решению Ученого совета создан отдельный институт – морская академия - для курсантов по всем эксплуатационным специальностям. Ее возглавил Николай Андреевич Алексеев.
Ранее Министр транспорта Российской Федерации Максим Соколов 11 сентября 2012 года подписал приказ о реорганизации двух крупных отраслевых вузов - Санкт-Петербургского государственного университета водных коммуникаций (СПГУВК) и Государственной морской академии имени адмирала С.О. Макарова (ГМА) в форме присоединения академии к университету. Новый вуз называется Государственный университет морского и речного флота имени адмирала С.О. Макарова.
