Система была создана и запущена в эксплуатацию Минтрансом России в 2013 году в целях обеспечения транспортной безопасности на всех видах транспорта, в том числе защищенности транспортных средств и инфраструктуры, пассажиров и персонала от актов незаконного вмешательства.
ЕГИС ОТБ представляет собой централизованную, территориально распределенную государственную систему и является объектом критической информационной инфраструктуры.
ЕГИС ОТБ обеспечивает информационную поддержку деятельности в области транспортной безопасности Минтранса России, Росавиации, Росжелдора, Росморречфлота, Росавтодора, Ространснадзора и других уполномоченных организаций и предприятий. В ведении системы – автоматизированный сбор и обработка персональных данных о пассажирах и персонале транспортных средств, которые используются при решении определяемых государством задач обеспечения транспортной безопасности.
.
Посредством инфраструктуры ЕГИС ОТБ уполномоченные органы оказывают государственные услуги и функции в области транспортной безопасности в цифровом виде. Переход от "бумаги" к "цифре" позволил отрасли транспортной безопасности сократить финансовые и временные затраты на совершение юридически значимых действий. С 2022 года сервис для заявителей доступен на портале Госуслуг, сообщает пресс-центр ФГУП "ЗащитаИнфоТранс".
Разработчиком ЕГИС ОТБ выступило подведомственное Минтрансу России ФГУП "ЗащитаИнфоТранс". ФГУП "ЗащитаИнфоТранс" осуществляет эксплуатацию системы на всех этапах жизненного цикла.
Постановление о новом положении о ЕГИС ОТБ было утверждено 1 августа 2023 года правительством Российской Федерации. Положение закрепляет цели, задачи, основные принципы функционирования, структуру, состав информационных ресурсов и информационных подсистем системы, состав и полномочия участников информационного взаимодействия, а также общие требования к защите информации, содержащейся в системе.