Институту от Главного управления гидрометеорологической службы были переданы НИС "Профессор Визе", "Профессор Зубов", "Океанограф", экспедиционный состав и база материально-технического снабжения.
"Профессор Визе" и "Профессор Зубов" - корабли одного проекта, построены в ГДР. Оба судна участвовали в крупной международной экспедиции "ПИГАП", в которой было задействовано 70 стран. На счету у каждого по два кругосветных плавания и более 5500 суток, проведенных в море. На борту были оборудованы 29 лабораторий и комплекс для запуска геофизических ракет.
В 1973 году "Профессор Зубов" участвовал в операции по освобождению дэ "Обь" из ледового плена. "Океанограф" - малое гидрографическое судно, переоборудованное из среднего рыболовного траулера.
На сегодняшний день в составе флота ААНИИ: ледостойкая самодвижущаяся платформа "Северный полюс", НЭС "Академик Фёдоров" и "Академик Трёшников". Также, подписано соглашение о строительстве нового судна "Иван Фролов".
